Факультет среднего профессионального образования начал осуществлять обучение с 1999 года в рамках института местного самоуправления. Первый набор проводился по двум специальностям: «Правоведение» и «Государственное и муниципальное управление». В январе 2000 года из института местного самоуправления выделили колледж как структурное подразделение академии. В том же году был произведен первый набор на специальность «Менеджмент». Летом 2002 года колледж был включен в структуру факультета довузовского образования, куда помимо колледжа входили профильные классы и подготовительные курсы. С осени 2003 года факультет довузовского образования разделен на факультет среднего профессионального образования и управление довузовского образования. В этом же году был произведен первый набор на специальность «Экономика и бухгалтерский учет».
На данный момент подготовка специалистов со средним профессиональным образованием осуществляется по основным образовательным программам следующих специальностей по очной форме обучения: